Нижнеудинск - второй кафедральный город Саянской епрхии.

В царское время в городе Нижнеудинске были построены величественные каменные соборы - в честь Вознесения Господня (1811 - 1835 гг.) и в честь Воскресения Господня (1780 - 1785 гг.). Но они были разрушены в годы утверждения советской власти. Действующим остался только небольшой деревянный Свято-Никольский храм, построенный при железнодорожной станции в 1908 году.

После образования Саянской епархии в 2011 году встаёт вопрос строительства в Нижнеудинске нового храма. Участок для храмового строительства был выделен на правом берегу реки Уды, примерно на том месте, где в 1648 году находился один из первых острогов Покровского городка (предшествующего возникновению Удинского острога), а в XVIII веке встал Воскресенский собор.

12 июля 2012 года, в праздник славных и всехвальных первоверховных апостолов Петра и Павла, на месте будущего строительства был установлен Крест. После этого в городе был создан Некоммерческий благотворительный фонд «Содействие в строительстве народного храма святых апостолов Петра и Павла».

24 и 25 апреля 2014 года епископ Саянский и Нижнеудинский Алексий совершил поездку в Нижнеудинск посетил площадку, выделенную администрацией города для возведения храма святых апостолов Петра и Павла. Владыку сопровождал главный архитектор Бюро архитектурно-строительного проектирования «АС про» Федор Иванович Афуксениди. Епископ Алексий и сопровождавшие его представители епархии встретились с мэром Нижнеудинска и специалистами муниципального отдела градостроительства и архитектуры. Во время встречи обсуждались вопросы проектирования храма.

12 июля 2016 года во время архипастырского визита в Нижнеудинск епископ Саянский и Нижнеудинский Алексий вместе с мэром города Александром Викторовичем Путовым провёл совещание, посвящённое вопросам строительства храма в честь апостолов Петра и Павла. Участниками совещания стали представители Саянской епархии, городской администрации и предприниматели города. На совещании были озвучены итоги деятельности некоммерческого благотворительного фонда «Содействие в строительстве народного храма святых апостолов Петра и Павла» за 2012 – 2015 годы. За три года на строительство храма было собрано 1 237 434 рубля. На эти средства были проведены инженерные изыскания, выполнено архитектурное проектирование.

В последующие годы была проведена значительная корректировка проекта и в 2019 году произведена заливка фундамента. В 2020 году начались строительные работы. Строителем храма выступил предприниматель Валерий Алексеевич Заречный. 

18 сентября 2020 года на строящемся храме установлены купола.

12 июля 2021 года завершились общестроительные работы. Окончание строительства было ознаменовано освящением звонницы.

12 июля 2022 года, в день памяти славных и всехвальных первоверховных апостолов Петра и Павла, епископ Алексий совершил чин малого освящения построенного храма. Его ктитор Валерий Алексеевич Заречный отмечен Медалью Саянской епархии "За усердные труды".